Eine Methode zum Visualisieren von massenspektrometrischem Bild erstellt, angepasst unter menschlicher Vision

Anonim
Eine Methode zum Visualisieren von massenspektrometrischem Bild erstellt, angepasst unter menschlicher Vision 14929_1
Eine Methode zum Visualisieren von massenspektrometrischem Bild erstellt, angepasst unter menschlicher Vision

Die Ergebnisse der Studie werden in der Zeitschrift Analytical Chemistry veröffentlicht. Die Massenspektrometrie mit hoher Auflösung ist ein Stoffanalyseverfahren, das auf der genauen Messung des Massenverhältnisses auf Ladung (m / z) ionisierte Moleküle basiert, und die Intensität des entsprechenden Signals von ihnen (ihre relative Menge). Mit dieser Information können Sie das Molekulargewicht der Verbindungen, ihrer Struktur bestimmen, dadurch, dass Verbindungen, beispielsweise Proteine, Lipide, Metaboliten, Peptide, Komponenten von Medikamenten und anderen Substanzen, ermittelt werden.

Massenspektrometrische Imijing (MCI) ermöglicht es Ihnen, Informationen über die räumliche Verteilung von Molekülen in Geweben zu erhalten, wodurch die massenspektrometrische Analyse von Ionen an der lokalen Laserionisierung von Molekülen an jedem Punkt der unter studierenden Probe (z. B. einem Tumorschnitt) leitet.

Die Interpretation von MSI-Daten ist eine schwierige Aufgabe. Zunächst ist es notwendig, die Verteilung von Ionen auf der Oberfläche der Gewebe-Cutoff-Oberfläche zu visualisieren, dh ein normales Farbbild, in dem jeder Bereich mit einer ähnlichen Ionenzusammensetzung - seiner Farbe entspricht. Von Tausenden von Ionen an jedem Punkt müssen Sie nur drei numerische Werte gehen, die die MSI-Daten als vollständig respektieren sollten und die mit dreidimensionaler Farbraum für seine anschließende Analyse des Forschers korreliert werden können.

Eine Methode zum Visualisieren von massenspektrometrischem Bild erstellt, angepasst unter menschlicher Vision 14929_2
Beschreibung der Methode / ©Koltech Pressendienst

"Es ist wichtig, den Informationsgehalt des daraus resultierenden Bildes zu maximieren, es ist notwendig, die Merkmale der menschlichen Vision, insbesondere ihrer Nichtlinearität und qualitativ unterschiedlicher Empfindlichkeit gegenüber Veränderungen in Helligkeit und Chroma zu berücksichtigen.

Und obwohl die Theorie der Farbwahrnehmung schon lange untersucht wird (seit der ersten Hälfte des 20. Jahrhunderts), auch bei den Experten, auch unter den Experten, nicht allgemein anerkannten mathematischen Modellen, die alle bekannten Eigenschaften der menschlichen Vision ziemlich gut beschreiben "Der erste Autor der Studie, sagt der Student SKOLTECH ANASTASIA SYYCHEV.

Forscher aus dem Zentrum der Wissenschafts- und Engineering-Computing-Technologien für Aufgaben mit großen Datenarrays (CDISE) und dem Labor von Visual SPI RAS bot einen neuen Ansatz zur Visualisierung von MSI-Daten, die bisher nicht zuvor bekannten Methoden in Bezug auf das Detail unterlegen, jedoch an der Gleichzeitig basierend auf der Theorie der menschlichen Farbwahrnehmung.

Die neue Methode behält sich Grenzen und Farbverläufe bei der Anwendung ausgewählter Bereiche einer ähnlichen ionischen Zusammensetzung. Dadurch wird das resultierende Bild leichter interpretiert als bei anderen Ansätzen der Bildgebung von MSI-Daten. Die Methode wurde sowohl auf Modell- als auch auf experimentellen Daten getestet, die von Forschern des Labors der Massenspektrometrie von Skolteha zusammen mit den Biologen des Zentrums der Neurobiologie und der Neuroabilität von Scothech erhalten wurden.

Quelle: Naked Science

Weiterlesen