Va compilar el catàleg més complet de virus que habiten l'intestí humà

Anonim
Va compilar el catàleg més complet de virus que habiten l'intestí humà 2040_1
Va compilar el catàleg més complet de virus que habiten l'intestí humà

Els virus són els objectes biològics més nombrosos del nostre planeta. I el nombre de bacteriòfags, també coneguts com a fagos - virus, infectant cèl·lules bacterianes i arqueines, segons les estimacions dels científics, és de 1031 partícules. Afecten fortament les comunitats microbianes, actuant com a vectors de transferència de gens horitzontals que codifiquen funcions auxiliars, útils per a tipus de bacteris-hosts.

Durant dècades, els investigadors han patit fges no tan ràpid com volien, però, a causa de l'aparició d'un metagenomyle d'alt rendiment, es va fer possible detectar un nombre sense precedents de nous phans. Així, el descobriment inesperat va ser que la majoria de les seqüències de fags no es podien atribuir a cap taxonomia viral coneguda establerta pel Comitè Internacional de Taxonomia del Virus (ICTV).

Se sap que els fages afecten diversos ecosistemes, i donada la importància de la composició i les funcions del microbioma intestinal per a la salut humana, l'atenció creixent va començar a dedicar-se als fags que habiten aquest cos. El desequilibri en l'agregat de bacteris condueix al desenvolupament de moltes malalties i estats complexos, com ara al·lèrgies i obesitat. No obstant això, fins ara, sabíem relativament poc sobre el paper que juguen els bacteris i els bacteriòfags intestinals en malalties sanitàries i humanes.

Els científics del laboratori d'interacció entre l'amfitrió i la microbiota a l'Institut de Senger i l'Institut Europeu de Bioinformàtica (Regne Unit), aplicant el mètode de seqüenciació d'ADN van fer un catàleg de biodiversitat d'espècies virals descobertes en 28.060 sèries de genomes intestinals humans recollits 28 països diferents en sis continents (Àfrica, Àsia, Europa, Amèrica del Nord, Amèrica del Sud i Oceania), i 2898 genomes d'aïllats bacterians, que van pujar d'aquest òrgan abdominal. Els resultats del seu treball es presenten a la revista Cell.

Els científics han descobert 142.809 genomes dels fags que viuen a l'intestí d'una persona, més de la meitat dels quals s'han conegut abans. La diversitat viral va resultar ser la més alta entre aquest tipus de bacteris com a empreses. Al mateix temps, al voltant del 36% dels clústers virals no es limitaven a un tipus, creant fluxos de xarxa de gens entre els tipus de bacteris filogenèticament diferents.

Va compilar el catàleg més complet de virus que habiten l'intestí humà 2040_2
Bacteriòfag i la seva estructura / © Getty Images

Entre desenes de milers de virus, els científics han identificat un nou conjunt de fags amb característiques que s'assemblen a bacteriòfags crassfags, descoberts el 2014 a les aigües residuals de molts països. Aquest grup infectant bacteris de bacteris anaeròbiques gram-negatives de la família Bacteroidaceae es deia Gubafag. I, segons experts, ella i crassfage, un avantpassat comú.

"També observem una clara separació entre els fagoms dels habitants d'Amèrica del Nord, Europa i Àsia i mostres d'Àfrica i Amèrica del Sud. Curiosament, els patrons de FAGIOMA (un conjunt de seqüències de tots els genomes de fags a la mostra. - Ref. Ed.) Correlacionat amb importants diferències en l'estil de vida d'una persona. I els fagos que es troben a les mostres urbanes van ser dirigides a bacteroides, però no en els bacteris de la família Prevotellacea, mentre que en mostres rurals de Perú, Tanzània, Madagascar i Fiji contenia fags amb una gamma de propietaris dirigits a Prevotellaceae en lloc de bacons, "Científics Li va dir.

Segons ells, el catàleg de gran escala de gran escala resultant de genomes de fagos millorarà els futurs estudis de virus: el component de virus del microbioma intestinal i que farà possible l'anàlisi ecològica i evolutiva dels bacteriòfags intestinals humans.

"Cal recordar que no tots els virus són perjudicials: són un component integral de l'ecosistema intestinal. La majoria dels virus que hem revelat tenim ADN com a material genètic, és a dir, difereixen dels patògens coneguts, com el Coronavirus SARS-COV-2 o el virus de Zika, que són virus d'ARN. En segon lloc, les nostres mostres es van obtenir principalment de persones sanes que no tenen malalties específiques ", va dir el Dr. Alexander Almeida, un dels autors de l'estudi.

Font: Ciència nua

Llegeix més