Va crear un mètode per visualitzar la imatge espectromètrica de masses, adaptada sota visió humana

Anonim
Va crear un mètode per visualitzar la imatge espectromètrica de masses, adaptada sota visió humana 14929_1
Va crear un mètode per visualitzar la imatge espectromètrica de masses, adaptada sota visió humana

Els resultats de l'estudi es publiquen a la revista Química Analítica. L'espectrometria de masses d'alta resolució és un mètode d'anàlisi de substàncies basat en la mesura precisa de la relació de massa a cobrar (M / Z) les molècules ionitzades i la intensitat del senyal corresponent d'ells (la seva quantitat relativa). Aquesta informació us permet determinar el pes molecular dels compostos, la seva estructura, que ajuda a identificar compostos, com ara proteïnes, lípids, metabòlits, pèptids, components de drogues i altres substàncies.

L'IMIJing espectromètric de masses (MCI) us permet obtenir informació sobre la distribució espacial de les molècules en els teixits, realitzant una anàlisi espectromètrica de masses d'ions a la ionització làser local de molècules a cada punt de la mostra sota estudi (per exemple, un tall de tumor).

La interpretació de les dades de MSI és una tasca difícil. Inicialment, cal visualitzar la distribució d'ions a la superfície de la superfície de tall de teixits, és a dir, construir una imatge de color normal, en la qual cada àrea que tingui una composició d'ions similars - correspon al seu color. A partir de milers d'ions en cada punt heu d'anar a només tres valors numèrics que haurien de respectar les dades MSI tan plenament i que es poden correlacionar amb un espai de color tridimensional per a la seva posterior anàlisi per part de l'investigador.

Va crear un mètode per visualitzar la imatge espectromètrica de masses, adaptada sota visió humana 14929_2
Descripció del mètode / © SKoltech Service de premsa

"És important maximitzar el contingut d'informació de la imatge resultant, cal tenir en compte les característiques de la visió humana, en particular, la seva no linealitat i una sensibilitat qualitativament diferent als canvis de brillantor i croma.

I, tot i que la teoria de la percepció de color s'examina durant molt de temps (des de la primera meitat del segle XX), fins i tot entre els experts no hi ha models matemàtics generalment acceptats, que descriuen bé totes les propietats conegudes de la visió humana ", diu el primer autor de l'estudi, estudiant graduat Skoltech Anastasia Sarychev.

Els investigadors del Centre de Tecnologies Científiques i d'Enginyeria Informàtica per a tasques amb grans matrius de dades (CDISE) i el Laboratori de Visual SPI Ras van oferir un nou enfocament de visualització de dades MSI, no inferior als mètodes prèviament coneguts en termes de detall, però al El mateix temps basat en la teoria de la percepció del color humà.

El nou mètode conserva els límits i els gradients en aplicar àrees seleccionades de composició iònica similar. En virtut d'això, la imatge resultant s'interpreta més fàcil que en altres enfocaments de la imatge de dades MSI. El mètode ha estat provat tant en dades de models com experimentals obtinguts per investigadors del laboratori d'espectrometria de masses de Skolteha juntament amb els biòlegs del centre de neurobiologia i la neuroabilitats de l'escoteca.

Font: Ciència nua

Llegeix més