Sastavio je najpotpuniji katalog virusa koji su naseljeni ljudskim crevima

Anonim
Sastavio je najpotpuniji katalog virusa koji su naseljeni ljudskim crevima 2040_1
Sastavio je najpotpuniji katalog virusa koji su naseljeni ljudskim crevima

Virusi su najbrojniji biološki objekti na našoj planeti. I broj bakteriofaga, poznat i kao fage - virusi, zaraze bakterijskih ćelija i arheays, prema procjenama naučnika, iznosi 1031 čestice. Oni snažno utječu na mikrobne zajednice, djelujući kao horizontalni vektori za prijenos gena koji kodiraju pomoćne funkcije, korisne za vrste bakterija-domaćina.

Desetljećima su istraživači pretrpjeli fage koji nisu tako brže koliko su htjeli, međutim, zbog pojave MetagenoMila visoke performanse, postao je moguće otkriti neviđeni broj novih fagira. Dakle, neočekivano otkriće bilo je da se većina faga nizova ne može pripisati bilo kojoj poznatoj virusnoj taksonomiji koja je utvrdio Međunarodni odbor za virus taksonomiju (ICTV).

Poznato je da fagi utječu na različite ekosustave i s obzirom na važnost sastava i funkcija crijevnog mikrobioma za zdravlje ljudi, sve veće pažnje počela je posvetiti fagima koji žive na fage koji u kojima žive. Neravnoteža u agregatu bakterija dovodi do razvoja mnogih bolesti i složenih država, poput alergija i gojaznosti. Međutim, do sada smo znali relativno malo o ulozi koje bakterije i bakteriofage igraju u zdravstvenim i ljudskim bolestima.

Naučnici iz laboratorije za interakciju domaćina i mikrobioti na Senagu i Evropskom institutu bioinformatike (Ujedinjeno Kraljevstvo), primjenjujući metodu sekvenciranja DNK napravila je katalog biološke raznolikosti virusnih vrsta prikupljenih u 28 različitih zemalja na šest kontinenata (Afrika, Azija, Evropa, Sjeverna Amerika, Južna Amerika i Okeanija) i 2898 genoma bakterijskih izolata, koji su podigli iz ovog trbušnog organa. Rezultati njihovog rada prikazani su u stajalištu ćelija.

Naučnici su otkrili 142.809 genoma fage koji žive u crevima osobe, više od polovine su se ikad ranije sreli. Pokazalo se da je virusna raznolikost bila najveća među takvom vrstom bakterija kao firmi. Istovremeno, oko 36% virusnih klastera nije bilo ograničeno na jednu vrstu, stvarajući mrežne tokove gena između filogenetički različitih vrsta bakterija.

Sastavio je najpotpuniji katalog virusa koji su naseljeni ljudskim crevima 2040_2
Bakteriofag i njena struktura / © Getty Images

Među desetinama tisuća virusa, naučnici su identificirali novi široko rasprostranjeni skup fala sa karakteristikama koji nalikuju bakteriofažom za izvlačenje, otkrivenim 2014. godine u otpadnim vodama mnogih zemalja. Ova grupa zarazila gram-negativne anaerobne bakterije bakterija bakterije Bacteoidaceae porodice nazvana je Gubafag. I, prema riječima stručnjaka, ona i Crassphage - zajednički predak.

"Takođe smo primijetili jasno razdvajanje između fagoma stanovnika Sjeverne Amerike, Evrope i Azije i uzoraka iz Afrike i Južne Amerike. Zanimljivo je da su fagioma obrasci (skup nizova svih fagotskih genomija u uzorku. - Ref. Ed.) Korelirano sa važnim razlikama u načinu života osobe. A fage koji se nalaze u uzorcima urbanim uzorcima, ali ne i na bakterije porodice prevodellacea, dok u ruralnim uzorcima iz Perua, Tanzanije, Madagaskar i Fidžia sadržavali su fage s nizom vlasnika, a namijenjeni za baktele, "naučnici rekao.

Prema njima, rezultirajući visokokvalitetni katalog velikih razmjera genoma fagera poboljšat će buduće studije virusa - virus komponentu crijevnog mikrobioma - i omogućit će ekološku i evolucijsku analizu ljudskih crevnih bakteriofaga.

"Mora da se pamti da nisu svi virusi štetni: oni su sastavni komponent crijevnog ekosustava. Većina virusa koji smo otkrili imaju DNK kao genetski materijal, odnosno razlikuju se od poznatih patogena, poput Coronavirus SARS-COV-2 ili virusa Zika, koji su virusi RNA. Drugo, naši su uzorci dobili uglavnom od zdravih ljudi koji nemaju nikakve određene bolesti ", rekao je dr. Aleksandar Almeida, jedan od autora studije.

Izvor: Gola nauka

Čitaj više