İnsan bağırsağında yaşayan virusların ən tam kataloqu tərtib etdi

Anonim
İnsan bağırsağında yaşayan virusların ən tam kataloqu tərtib etdi 2040_1
İnsan bağırsağında yaşayan virusların ən tam kataloqu tərtib etdi

Viruslar planetimizdəki ən çox sayda bioloji obyektdir. Elm adamlarının hesablamalarının fikrincə, bakterial hüceyrələr və arxeeys yoluxucu, fənlər - viruslar kimi tanınan bakteriofajların sayı 1031 hissəcikdir. Mikrob icmalarına güclü təsir edir, üfüqi gen köçürmə vektorları kimi fəaliyyət göstərən köməkçi funksiyalar, bakteriya ev sahibləri üçün faydalıdır.

On illərdir ki, tədqiqatçılar istədikləri qədər sürətli olmayan mərhələlərdən əziyyət çəkdilər, lakin yüksək effektiv metagenomyle meydana gəlməsi səbəbindən, görünməmiş bir sayda yeni mərhələni aşkar etmək mümkün oldu. Beləliklə, gözlənilməz kəşf, fajaq ardıcıllığının əksəriyyəti, Beynəlxalq Virus Taxonomiya (İKTV) tərəfindən yaradılan heç bir məlum viral taksonomiyasına aid edilə bilmədi.

Müxtəlif ekosistemlərə təsir etdiyini bilinən və insan sağlamlığı üçün bağırsaq mikrobiomasının tərkibi və funksiyalarının əhəmiyyətini nəzərə alaraq, bu bədənin yaşadığı mərhələlərə həsr etməyə başladığı məlumdur. Bakteriyaların məcmuəsində balanssızlıq, allergiya və piylənmə kimi bir çox xəstəliklərin və mürəkkəb dövlətlərin inkişafına səbəb olur. Ancaq indiyə qədər bağırsaq bakteriyaları və bakteriofajların sağlamlıq və insan xəstəliklərində oynadığı rol haqqında nisbətən az şey bilirdik.

Sərgi İnstitutunda və Avropa Bioinformatika İnstitutunda ev sahibi və mikrobiota arasındakı qarşılıqlı əlaqə laboratoriyasından olan elm adamları və Avropa Bioinformatika İnstitutu (Birləşmiş Krallıq), DNT ardıcıllığı metodunu tətbiq edən viral növlərin biomüxtəlifliyinin kataloqu təşkil edilən 28,060 dəstə bütpərəstlik genomlarında aşkar edilmişdir Altı qitədə (Afrika, Asiya, Avropa, Şimali Amerika, Cənubi Amerika və Okeaniya) 28 fərqli ölkə, bu qarın orqanından qaldırılan 2898 bakteriya təcridlərin 2898 genomu. İşlərinin nəticələri hüceyrə jurnalında təqdim olunur.

Elm adamları bir insanın bağırsağında yaşayan, əvvəllər birdən çoxu əvvəllər görüşmüşdür. Viral müxtəliflik, firmalar kimi bakteriyaların növü arasında ən yüksək olduğu ortaya çıxdı. Eyni zamanda, viral klasterlərin 36% -i, bir növ, filogenetik olaraq müxtəlif növ bakteriyalar arasında genlərin şəbəkə axınları yaratmaqla məhdudlaşmadı.

İnsan bağırsağında yaşayan virusların ən tam kataloqu tərtib etdi 2040_2
Bakteriofaj və onun quruluşu / © Getty Images

On minlərlə virus arasında, elm adamları bir çox ölkənin çirkab sularında kəşf edilmiş krassefon bakteriofajına bənzəyən xurma bakteriofajına bənzəyən yeni geniş yayılmış mərhələləri müəyyənləşdirdilər. Bakteroidaceae ailənin qram mənfi anaerob bakteriya bakteriyalarına yoluxucu bu qrup Gubafag adlanırdı. Və mütəxəssislərin fikrincə, o və cırtdan - ortaq bir əcdad.

"Şimali Amerika, Avropa və Asiya və Afrika və Cənubi Amerikanın nümunələrinin fagomları arasında açıq bir ayrılıq müşahidə etdik. Maraqlıdır ki, fagioma naxışları (nümunədə bütün mərhələli bütün mərhələlərin ardıcıllığı. - ref. Ed.)) Bir insanın həyat tərzindəki vacib fərqlərlə əlaqələndirilir. Və şəhər nümunələrində tapılan rəflər bakteriyalara yönəldilmiş, lakin promotellacea ailəsinin bakteriyalarında deyil, Peru, Tanzaniya, Madaqaskar və Fici-də kənd nümunələri, bakteroidlərin əvəzinə prevrotellaceae olan bir sıra sahibləri olan mərhələlərdən ibarətdir "elm adamları dedi.

Onların sözlərinə görə, mərhələli phage genomlarının yüksək keyfiyyətli geniş miqyaslı kataloqu virusun gələcək tədqiqatlarını - bağırsaq mikrobiomasının virus komponenti - və insan bağırsaq bakteriofizlərinin ekoloji və təkamül analizinə imkan yaradacaqdır.

"Xatırlamaq lazımdır ki, bütün viruslar zərərli deyil: bağırsaq ekosisteminin ayrılmaz bir hissəsidir. Göndərdiyimiz virusların əksəriyyəti DNT-nin bir genetik material kimi olduğunu, yəni Coronavirus SARS-COV-2 və ya RNT virusları olan Zika virusu kimi tanınmış patogenlərdən fərqlənir. İkincisi, nümunələrimiz əsasən heç bir xüsusi xəstəlikləri olmayan sağlam insanlardan əldə edildi "dedi.

Mənbə: Çılpaq elm

Daha çox oxu