Saamgestel die mees volledige katalogus van virusse wat die menslike dunderm bewerkstellig

Anonim
Saamgestel die mees volledige katalogus van virusse wat die menslike dunderm bewerkstellig 2040_1
Saamgestel die mees volledige katalogus van virusse wat die menslike dunderm bewerkstellig

Virusse is die mees talle biologiese voorwerpe op ons planeet. En die aantal bakteriofage, ook bekend as fages - virusse, wat bakteriese selle en argeys besmet, volgens wetenskaplikes se ramings, is 1031 deeltjies. Hulle beïnvloed die mikrobiese gemeenskappe sterk, wat optree as horisontale geen-oordragvektore wat hulpmiddels kodering, wat nuttig is vir tipes bakterieë-leërskare.

Vir dekades het navorsers nie so vinnig gely nie, nie so vinnig soos wat hulle wou hê nie. As gevolg van die opkoms van 'n hoëprestasie-metagenomyle het dit moontlik geword om 'n ongekende aantal nuwe fages op te spoor. Dus, die onverwagte ontdekking was dat die meerderheid van fage-rye nie toegeskryf kan word aan enige bekende virale taksonomie wat deur die Internasionale Komitee oor Virus Taksonomie (IKTV) ingestel is nie.

Dit is bekend dat die fages verskeie ekosisteme beïnvloed, en die belangrikheid van die samestelling en funksies van die derm mikrobioom vir menslike gesondheid gegee het, het toenemende aandag begin om aan die fages wat in hierdie liggaam woon, te bestee. Die wanbalans in die totaal van bakterieë lei tot die ontwikkeling van baie siektes en komplekse state, soos allergieë en vetsug. Tot dusver het ons egter relatief min geweet oor die rol wat intestinale bakterieë en bakteriofages in gesondheids- en menslike siektes speel.

Wetenskaplikes van die laboratorium van interaksie tussen die gasheer en mikrobiota by die Instituut van Senger en die Europese Instituut van Bioinformatika (Verenigde Koninkryk), wat die DNA-opeenvolgingsmetode toegepas het, het 'n katalogus van biodiversiteit van virale spesies wat in 28,060 stelle menslike intestinale genome ingesamel is, aangebring gemaak. 28 verskillende lande in ses kontinente (Afrika, Asië, Europa, Noord-Amerika, Suid-Amerika en Oseanië), en 2898 genome van bakteriese isolate, wat uit hierdie abdominale orgaan opgewek het. Die resultate van hul werk word in sel tydskrif aangebied.

Wetenskaplikes het 142,809 genome ontdek van die fages wat in die dunderm van 'n persoon woon, meer as die helfte van wie ooit voorheen ontmoet het. Virale diversiteit blyk die hoogste onder so 'n soort bakterieë as maatskappye te wees. Terselfdertyd was ongeveer 36% van virale klusters nie beperk tot een tipe nie, wat netwerkstrome van gene tussen filogeneties verskillende tipes bakterieë skep.

Saamgestel die mees volledige katalogus van virusse wat die menslike dunderm bewerkstellig 2040_2
Bakteriofage en sy struktuur / © getty beelde

Onder tienduisende virusse het wetenskaplikes 'n nuwe wydverspreide stelfages geïdentifiseer met eienskappe wat in 2014 in die afvalwater van baie lande in die afvalwater ontdek het. Hierdie groep besmet Gram-negatiewe anaërobiese bakterieë bakterieë van die Bakteroidaceae-familie is Gubafag genoem. En volgens kenners het sy en Crassfage - 'n gemeenskaplike voorouer.

"Ons het ook 'n duidelike skeiding tussen die fagoms van die inwoners van Noord-Amerika, Europa en Asië en monsters van Afrika en Suid-Amerika waargeneem. Interessant genoeg, fagioma patrone ('n stel rye van alle faggenome in die steekproef. - Ref. Ed.) Korreleer met belangrike verskille in die lewenstyl van 'n persoon. En die fhoegte wat in stedelike monsters gevind is, was gemik op bacteroids, maar nie op die bakterieë van die Prevotelelacea-familie nie, terwyl in landelike monsters van Peru, Tanzanië, Madagaskar en Fiji fages bevat met 'n verskeidenheid eienaars wat op Prevotellaceae gemik is in plaas van bacteroides, "wetenskaplikes Vertel.

Volgens hulle sal die gevolglike hoë-gehalte grootskaalse katalogus van die fages van hoë gehalte die toekomstige studies van die virus verbeter - die virus-komponent van die derm mikrobioom - en sal dit moontlik maak vir ekologiese en evolusionêre analise van menslike dermbakterieë.

"Dit moet onthou word dat nie alle virusse skadelik is nie: hulle is 'n integrale komponent van die intestinale ekosisteem. Die meeste van die virusse wat ons geopenbaar het, het DNA as 'n genetiese materiaal, dit is verskil van die bekende patogene, soos Coronavirus Sars-COV-2 of die Zika-virus, wat RNA-virusse is. Tweedens is ons monsters hoofsaaklik verkry uit gesonde mense wat geen spesifieke siektes het nie, "het dr. Alexander Almeida, een van die skrywers van die studie, gesê.

Bron: Naakte Wetenskap

Lees meer